旬阳县旬河以及汉江干流河道采砂现象多
就具体问题而言，在重访水源地过程中，人民网记者发现相比一年前陕西在保护南水方面做出了不少努力，也取得了不少成绩，但是仍然存在一些问题，比如在安康市汉滨区汉江沿线早阳镇沿岸居民聚集区汉江沿岸垃圾较多，影响水质，汉滨区有些靠近居住区的小流域河道内垃圾较多，旬阳县旬河以及汉江干流河道采砂情况严重。旬阳当地居民告诉记者最近几年由于采砂多频繁致使河水比较浑浊，有些采砂沙堆直接堆积到主河道影响河流正常行洪。
陕西省南水北调办主任朱昱告诉记者，陕西在两场（垃圾处理场和污水处理厂）方面建设资金缺口10个亿，28个县区建成两场运营资金缺口9000万，水土保持小流域治理方面资金缺口3.7个亿。
在实际走访中，人民网记者了解到，陕南多地在人员配备方面比较薄弱，陕西省南水北调办仅配备一名专职副主任，未配备编制和专职工作人员，工作上依靠省发改委区域处。区域处承担的职责任务重，人员较少，南水北调工作陷入被动应付局面。陕南三市虽均已设立了机构并配备编制，但都是参照省上的做法，依然挂靠于市级发改部门，人员配备比较单薄，多数县区南水北调办只有一名工作人员。
以商洛市为例，水源地保护限制了工业经济发展。为保护水质，对于控制水源涵养区污染源、稀有金属开发项目及造纸、化工产业项目受到严重限制。以2013年为基期测算，每年将减少工业产值超过50亿元，财政减收4—5亿元，每年工业产值将减少220亿元以上。对于面源污染治理增加了农业产业成本，由于严格限制农业生产中的化肥、农药使用，导致农作物产量明显下降；作为山区市，占农村总人口三分之一的养殖户因划定了禁养区和限制区而放弃养殖；以杂木为原料的食用菌产业受禁伐政策的影响，散种食用菌户基本绝迹，因而农民收入受到很大影响，人均收入减少1000元左右。
如何保证丹江口水库的水质良好，处理好水质保护和脱贫致富关系，南水北调水源地保护任重而道远。
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